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Sete meses depois que a Guerra de Um Ano acabou, os restantes da reforma do Principado de Zeon na República de Zeon continuam a lutar. Daryl tinha pilotado o robô Psycho Zaku no final da guerra no Setor Thunderbolt, onde a frota da Irmandade Moore foi aniquilada. Depois de perder o Psycho Zaku, Daryl desce à Terra e assume uma posição de inteligência para juntar informações sobre a Aliança dos Mares do Sul, um grupo militar dentro da Federação Terrestre. Io, que enfrentou Daryl, é selecionado para pilotar o robô protótipo Atlas Gundam e vai em direção à Terra.
Lupin tenta e não consegue roubar um valioso conjunto de chapas fotográficas japonesas. O legítimo dono das placas, Michael Suzuki, é um multimilionário que se prepara para abrir um enorme parque aquático em Tóquio. Lupin tenta obter a ajuda de seus firmes camaradas Jigen e Goemon, mas os considera menos confiáveis; Jigen está sofrendo de uma dor de dente que atrapalha sua lendária pontaria, e Goemon vergonhosamente teve sua espada, Zantetsuken, roubada por uma mulher e dada a Suzuki para exibir em sua coleção de arte. O grupo trabalha em um plano com Fujiko para obter as placas e o Zantetsuken.
Lupin investiga a notícia de uma versão falsa de um de seus cartões de visita durante uma festa de alta classe. Um grupo de assassinos, o Tarantula, invade a festa e mata o anfitrião. Zenigata, investigando o cartão, persegue Lupin, mas acaba baleado e ferido por uma prata Walther P38. Lupin, vislumbrando a arma familiar, está determinado a vingar não apenas Zenigata, mas um episódio de seu passado.